在选择通风柜时，往往会认为通风柜表面风速越大效果越好。其实不然，表面风速越大，在相同条件下，通风柜所需的排风量也越大，这将会带来很多不利因素。主要表现在：
1、设备初投资增大

这部分包括：排风设备、补风设备、空气处理设备、空调设备、消声减振设备和控制设备六部分。

1）排风量增大，则排风机型号和排风管道尺寸必增大，从而增大了排风设备造价；

2）排风量增大，为维持室内正常工作压力，室外补风量增大，则其补风设备和补风管道尺寸也将要增大。当室内通风柜数量较少，且排风量较小时，室内补风可由空调送风来负担；

3）通风柜排出的有害气体，在排出室外前必须进行处理，若排风量增大，为了处理相应量的废气，则处理设备容量也要增大。

4）为了保证实验室内舒适的工作环境，室内需维持稳定的温度和湿度。排风量增大，空调设备的负荷将增大，所以设备型号也将增大。当室内通风柜数量较多时，这部分投资增大更明显；

5）由于排风设备、补风设备和空调设备型号增大，则其在运行过程中所产生的噪声和振动必须考虑。因此，排风量增大，也将影响到降噪减振设备投资的增大。

6）排风量增大，由于排风系统、补风系统和空调系统的设备选型都增大，则其控制系统选型相应地也应增大。

2、工程安装费用和施工难度增大

如前所述，通风柜排风量增大，相应的设备型号和管道尺寸都增大，这必将增加工程安装费用，加大了工程施工难度，延缓工程施工进度。

3、降低建筑层高

增大通风柜排风量，为达到理想的排风效果，则管道尺寸相应地要增大。由于管道一般安装在吊顶内，风管尺寸增大，势必降低吊顶高度，减小建筑层高，造成空间压抑感。

4、系统噪声增大

系统设备型号增大，则各系统设备在运行过程中所产生的噪声和振动也将增大。虽然在系统中增加了降噪减振设备，但由设备型号增大所引起的附加噪声和振动并不能完全消除。

5、运行费用增多

设备型号增大，其相应的输入电功率也将增大，因此，系统总的运行费用将大大增加。为维持室内一定的温度，空调设备必须负担由于通风柜排风造成的能量损失。以下是不同表面风速标准下，由通风柜排风造成的空调设备全年的额外运行费用。